Xenogears nasce dal team di sviluppo della Squaresoft già parzialmente responsabile della produzione di Chrono Trigger. Sin dagli inizi il gioco ha avuto una vita travagliata. Dopo l'uscita giapponese la Square si è dimostrata subito restìa alla localizzazione occidentale, temendo lamentele relative ai contenuti religiosi presenti in gran massa nel gioco. Alla fine il gioco è riuscito ad approdare in America grazie a numerose petizioni firmate dai fan e ad una partnership di distribuzione come la Electronic Arts. Essendo uscito tra FFVII e FFVIII e nello stesso periodo di Metal Gear Solid sembrava sicuro che Xenogears dovesse rimanere un titolo destinato a poca attenzione; per fortuna la sua alta qualità gli hanno permesso di distinguersi nel panorama degli RPG, malgrado le difficoltà poste dalla Squaresoft stessa. Purtroppo infatti il team di sviluppo ad un certo punto del lavoro ha subito un taglio di fondi e di tempo (presumibilmente per non far avvicinare la data di uscita di Xenogears a quella di FFVIII); questo ha influito molto sulla qualità del secondo cd del gioco come vedremo fra poco.